MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Mycobacterium yongonense 05-1390

Total Repeats: 148730

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021715	ACG	2	6	27	32	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_021715	GCC	2	6	87	92	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523911442
3	NC_021715	GCA	2	6	125	130	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523911442
4	NC_021715	TCG	2	6	166	171	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523911442
5	NC_021715	CTG	2	6	183	188	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523911442
6	NC_021715	AGC	2	6	198	203	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523911442
7	NC_021715	GCC	3	9	259	267	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523911442
8	NC_021715	ACA	2	6	272	277	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523911442
9	NC_021715	CGA	2	6	311	316	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523911442
10	NC_021715	CGG	2	6	340	345	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523911442
11	NC_021715	CGC	2	6	386	391	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523911442
12	NC_021715	CGA	2	6	401	406	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523911442
13	NC_021715	CGC	2	6	497	502	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523911442
14	NC_021715	CCG	2	6	518	523	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523911442
15	NC_021715	TGC	2	6	661	666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523911442
16	NC_021715	CGC	2	6	668	673	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523911442
17	NC_021715	GAA	2	6	729	734	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523911442
18	NC_021715	TCA	2	6	748	753	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523911442
19	NC_021715	CGA	2	6	764	769	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523911442
20	NC_021715	CGACGT	2	12	800	811	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	523911442
21	NC_021715	GCT	2	6	812	817	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523911442
22	NC_021715	AAGG	2	8	846	853	50 %	0 %	50 %	0 %	523911442
23	NC_021715	AGG	2	6	859	864	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	523911442
24	NC_021715	TTC	2	6	867	872	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523911442
25	NC_021715	CAA	2	6	899	904	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523911442
26	NC_021715	GCC	2	6	929	934	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523911442
27	NC_021715	AGC	2	6	937	942	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523911442
28	NC_021715	GCC	2	6	1004	1009	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523911442
29	NC_021715	CGA	2	6	1073	1078	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523911442
30	NC_021715	CAG	2	6	1097	1102	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523911442
31	NC_021715	CCA	2	6	1252	1257	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	523911442
32	NC_021715	GCC	2	6	1263	1268	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523911442
33	NC_021715	CCG	2	6	1270	1275	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523911442
34	NC_021715	ACC	2	6	1287	1292	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	523911442
35	NC_021715	GGA	2	6	1295	1300	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	523911442
36	NC_021715	ACCAC	2	10	1417	1426	40 %	0 %	0 %	60 %	523911442
37	NC_021715	CGCAA	2	10	1438	1447	40 %	0 %	20 %	40 %	523911442
38	NC_021715	GCG	2	6	1469	1474	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523911442
39	NC_021715	CAC	2	6	1502	1507	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	523911442
40	NC_021715	GC	3	6	1558	1563	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
41	NC_021715	T	6	6	1566	1571	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_021715	CG	3	6	1584	1589	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
43	NC_021715	CA	3	6	1633	1638	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
44	NC_021715	CGT	2	6	1681	1686	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_021715	CGC	2	6	1723	1728	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
46	NC_021715	TCG	2	6	1746	1751	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_021715	TTC	2	6	1826	1831	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_021715	CGT	2	6	1880	1885	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_021715	GGA	2	6	1931	1936	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_021715	GTT	2	6	1943	1948	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_021715	GTC	3	9	1966	1974	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_021715	G	6	6	2019	2024	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
53	NC_021715	TGAAGG	2	12	2053	2064	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_021715	CGA	2	6	2081	2086	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523911443
55	NC_021715	GTGG	2	8	2151	2158	0 %	25 %	75 %	0 %	523911443
56	NC_021715	GAA	2	6	2160	2165	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523911443
57	NC_021715	CGGTGC	2	12	2183	2194	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	523911443
58	NC_021715	TGC	2	6	2204	2209	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523911443
59	NC_021715	CGA	2	6	2426	2431	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523911443
60	NC_021715	CCG	2	6	2489	2494	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523911443
61	NC_021715	CGA	2	6	2541	2546	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523911443
62	NC_021715	GGT	2	6	2595	2600	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523911443
63	NC_021715	GCC	2	6	2605	2610	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523911443
64	NC_021715	CGG	2	6	2651	2656	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523911443
65	NC_021715	GCC	2	6	2710	2715	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523911443
66	NC_021715	GCA	2	6	2813	2818	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523911443
67	NC_021715	GCT	2	6	2859	2864	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523911443
68	NC_021715	GCCG	2	8	2865	2872	0 %	0 %	50 %	50 %	523911443
69	NC_021715	CGA	2	6	2888	2893	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523911443
70	NC_021715	CGA	2	6	3006	3011	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523911443
71	NC_021715	GGCCG	2	10	3016	3025	0 %	0 %	60 %	40 %	523911443
72	NC_021715	AAG	2	6	3026	3031	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523911443
73	NC_021715	CGAT	2	8	3038	3045	25 %	25 %	25 %	25 %	523911443
74	NC_021715	TGC	2	6	3161	3166	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523911443
75	NC_021715	GAC	3	9	3178	3186	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523911443
76	NC_021715	CCGGG	2	10	3197	3206	0 %	0 %	60 %	40 %	523911443
77	NC_021715	CCGA	2	8	3223	3230	25 %	0 %	25 %	50 %	523911443
78	NC_021715	GCC	2	6	3463	3468	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523911444
79	NC_021715	ACG	2	6	3497	3502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523911444
80	NC_021715	GCGGG	2	10	3535	3544	0 %	0 %	80 %	20 %	523911444
81	NC_021715	GCA	2	6	3578	3583	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523911444
82	NC_021715	CG	3	6	3607	3612	0 %	0 %	50 %	50 %	523911444
83	NC_021715	GTT	2	6	3615	3620	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523911444
84	NC_021715	GCG	2	6	3647	3652	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523911444
85	NC_021715	CGC	2	6	3667	3672	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523911444
86	NC_021715	CGA	2	6	3678	3683	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523911444
87	NC_021715	GCCG	3	12	3698	3709	0 %	0 %	50 %	50 %	523911444
88	NC_021715	GGC	2	6	3711	3716	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523911444
89	NC_021715	GC	3	6	3720	3725	0 %	0 %	50 %	50 %	523911444
90	NC_021715	GA	3	6	3733	3738	50 %	0 %	50 %	0 %	523911444
91	NC_021715	TGC	2	6	3740	3745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523911444
92	NC_021715	GC	3	6	3779	3784	0 %	0 %	50 %	50 %	523911444
93	NC_021715	TCGCC	2	10	3834	3843	0 %	20 %	20 %	60 %	523911444
94	NC_021715	CTG	2	6	3922	3927	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523911444
95	NC_021715	CGC	2	6	3981	3986	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523911444
96	NC_021715	CGG	2	6	3999	4004	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523911444
97	NC_021715	GGTC	2	8	4086	4093	0 %	25 %	50 %	25 %	523911444
98	NC_021715	GAC	2	6	4102	4107	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523911444
99	NC_021715	GCCA	2	8	4147	4154	25 %	0 %	25 %	50 %	523911444
100	NC_021715	CGC	2	6	4191	4196	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523911444
101	NC_021715	GCT	2	6	4203	4208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523911444
102	NC_021715	GC	3	6	4209	4214	0 %	0 %	50 %	50 %	523911444
103	NC_021715	CGA	2	6	4215	4220	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523911444
104	NC_021715	TTG	2	6	4234	4239	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523911444
105	NC_021715	CGA	2	6	4242	4247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523911444
106	NC_021715	CCG	2	6	4325	4330	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523911444
107	NC_021715	GTC	2	6	4333	4338	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523911444
108	NC_021715	CGG	2	6	4349	4354	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523911444
109	NC_021715	CCGG	2	8	4400	4407	0 %	0 %	50 %	50 %	523911444
110	NC_021715	GC	3	6	4419	4424	0 %	0 %	50 %	50 %	523911444
111	NC_021715	CGG	2	6	4460	4465	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_021715	GAG	2	6	4512	4517	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	523911445
113	NC_021715	GCG	3	9	4524	4532	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523911445
114	NC_021715	CG	4	8	4531	4538	0 %	0 %	50 %	50 %	523911445
115	NC_021715	CGGCCG	2	12	4553	4564	0 %	0 %	50 %	50 %	523911445
116	NC_021715	GCG	2	6	4601	4606	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523911445
117	NC_021715	GC	3	6	4662	4667	0 %	0 %	50 %	50 %	523911445
118	NC_021715	GGT	2	6	4736	4741	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523911445
119	NC_021715	CCA	2	6	4745	4750	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	523911445
120	NC_021715	GAT	2	6	4838	4843	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523911445
121	NC_021715	GTT	2	6	4853	4858	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523911445
122	NC_021715	CGC	3	9	4868	4876	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523911445
123	NC_021715	GTG	2	6	4890	4895	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523911445
124	NC_021715	GCCG	2	8	4916	4923	0 %	0 %	50 %	50 %	523911445
125	NC_021715	CGT	2	6	4927	4932	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523911445
126	NC_021715	GCC	2	6	5002	5007	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
127	NC_021715	TGA	2	6	5200	5205	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
128	NC_021715	CCGC	2	8	5210	5217	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
129	NC_021715	AGA	3	9	5256	5264	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523911446
130	NC_021715	CAC	2	6	5372	5377	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	523911446
131	NC_021715	GGT	2	6	5389	5394	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523911446
132	NC_021715	CGA	2	6	5407	5412	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523911446
133	NC_021715	CAA	2	6	5431	5436	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523911446
134	NC_021715	CGA	2	6	5455	5460	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523911446
135	NC_021715	CGT	2	6	5536	5541	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523911446
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265	NC_021715	CGCGG	2	10	9890	9899	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
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267	NC_021715	GC	3	6	10062	10067	0 %	0 %	50 %	50 %	523911448
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380	NC_021715	C	6	6	14685	14690	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
381	NC_021715	CGCC	2	8	14698	14705	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
382	NC_021715	CGG	2	6	14717	14722	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
383	NC_021715	CAA	2	6	14753	14758	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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385	NC_021715	CAC	2	6	14840	14845	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
386	NC_021715	GGT	2	6	14907	14912	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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388	NC_021715	GTCG	2	8	14963	14970	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
389	NC_021715	GCT	2	6	14972	14977	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523911454
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392	NC_021715	GACCTT	2	12	15181	15192	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	523911454
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397	NC_021715	TGC	2	6	15452	15457	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523911455
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399	NC_021715	CACG	2	8	15465	15472	25 %	0 %	25 %	50 %	523911455
400	NC_021715	CGG	2	6	15480	15485	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523911455
401	NC_021715	TGG	2	6	15518	15523	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523911455
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417	NC_021715	GC	3	6	16148	16153	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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441	NC_021715	CCGG	3	12	17126	17137	0 %	0 %	50 %	50 %	523911457
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